V Amazonském pralese přežívá tajný druh Transformerů – Maximals, kteří se skrývají jako zvířata. Když hrozí zničení Země požíračem Unicronem, Optimus Prime se spojí s vůdcem Maximals, aby čelili této hrozbě. Dva obyčejní smrtelníci, Noah a Elena, se rozhodnou pomoci v boji o osud planety.

Středoškolský učitel Dan Forester žije poklidný život, dokud nepřijdou návštěvníci z budoucnosti s děsivým varováním – za 30 let lidstvo čeká ničivá válka s mimozemšťany. Aby přežili, musí rekrutovat vojáky z minulosti. Dan se ocitá v boji o záchranu světa, kde čelí nelítostným tvorům i vlastnímu osudu.

Druhého července se obří vesmírné lodě objeví nad největšími městy světa. Lidé jsou nepřipraveni a brzy čelí drtivému útoku mimozemšťanů, kteří chtějí lidstvo vyhladit. Z trosek povstává hrstka přeživších, kteří se s odvahou snaží zastavit nadcházející zkázu. Osud planety visí na vlásku.

Scenárista David Koepp přenesl slavný román H. G. Wellse do současnosti. Dělník Ray Ferrier (Tom Cruise) řeší rodinné problémy, ale brzy čelí mnohem větší hrozbě – mimozemské invazi. Nepřátelé, technologicky vyspělejší než lidstvo, likvidují civilizaci. Ray se musí semknout s rodinou a bojovat o přežití v tomto apokalyptickém chaosu.

V roce 1961 ztroskotalo vesmírné plavidlo Ark na Měsíci, nesoucí tajný náklad, který mohl změnit osud planety. NASA v roce 1969 poslala Apollo 11, aby loď prozkoumala. V současnosti Sam Witwicky, po předchozím vítězství nad Deceptikony, zjistí, že Deceptikoni skrývají na Zemi nebezpečný plán, a vydává se na Měsíc odhalit pravdu.